היחידה תהווה פלטפורמה מודיעינית ומבצעית ללחימה כנגד מחוללי הפשיעה בגבולות, ותפעל כנגד מבריחי הסמים והאמל"ח
לאורכם של 340 ק"מ של גבולות השלום עם ירדן ומצרים.

יחידת מג"ן הוקמה עפ"י החלטת מפכ"ל המשטרה לאור התגברות תופעת ההברחות בגבול מצרים וירדן שבגזרת המחוז הדרומי,
ובמטרה לשפר את היכולת להתמודד עם התופעה במסגרת המבנה הקיים של ימ"ר נגב.

בחודשים האחרונים אותרו ונבחרו לשרות ביחידה מיטב הלוחמים ממרחב הנגב וממחוז הדרום. הלוחמים, כולם בוגרי יחידות קרביות בצה"ל, עברו אימון הקמה מקצועי ובו התמחו בפרמטרים שונים הקשורים להפעלת היחידה כגון : תצפיות , ניווטים , מרדפים, נהיגה מבצעית ועוד.

בשלב ראשון תמנה היחידה 25 לוחמים ולמפקדה הראשון מונה פקד יעקב מור. פקד מור, יוצא יחידה מובחרת בצה"ל שימש בעבר כק' מודיעין וכמפקד יחידת סיור במשטרת באר שבע . פקד מור נבחר על ידי מפקד המרחב  לעמוד בראש היחידה ולפקד על הקמתה.

מפכ"ל המשטרה התייחס לחשיבות הלחימה בפשיעה ולחשיבות הקמתה של יחידת מג"ן ואמר כי "משטרת ישראל תקדם
בשנת 2008 מספר מהלכים אסטרטגיים כחלק מתפיסת עולם בסיסית ומבצעית שתכליתה לחימה בפשיעה".

מפקד המחוז הדרומי הוסיף ואמר כי "בעוד חצי שנה נראה את תוצאות עבודתה של היחידה לאחר שקיבלה את כל האמצעים
ואת מיטב האנשים".